Betaling for adgangen til erhvervsmæssig udnyttelse af immaterielle rettigheder vil typisk være en kombination af et engangsbeløb samt løbende royalty.
Et alternativ kan være stykafgift beregnet på baggrund af virksomhedens omsætning, baseret på udnyttelse af opfindelsen.
Betaling kan desuden ske i form af aktier i rettighedskøberens virksomhed.
Ofte vil overdragelse af rettigheder medføre, at virksomheden foretager køb af forskningsydelser på institutionen.
Det sker med henblik på videreudvikling af teknologien, da den typisk overdrages umoden.
Overdragelse af rettigheder i forskningssamarbejder skal dog afspejle virksomhedens eget bidrag i forbindelse med forskningssamarbejdet.
Det er institutionernes politik, at betaling for immaterielle rettigheder skal være fair og i overensstemmelse med almindelige markedsvilkår.